Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STRN3Q13033 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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