Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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