Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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