Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms