Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms