Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms