Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms