Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCN1BQ07699 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms