Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNDQ07001 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms