Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTDSPL2Q05D32 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms