Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms