Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms