Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PLOD1Q02809 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLOD1Q02809 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PLOD1Q02809 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PLOD1Q02809 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLOD1Q02809 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLOD1Q02809 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms