Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUD4Q01804 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms