Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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