Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms