Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A1P68400 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms