Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACTA1P68133 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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