Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 C16orf82-202ENST00000505035 2459 ntAPPRIS P5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ACSL1-210ENST00000513317 2469 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 LAMA4-219ENST00000522006 6438 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ROMO1P60602 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms