Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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