Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN15P56746 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CLDN15P56746 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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