Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEC13P55735 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEC13P55735 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEC13P55735 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms