Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CASP9P55211 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CASP9P55211 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CASP9P55211 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms