Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AIF1P55008 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AIF1P55008 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms