Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF143P52747 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF143P52747 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms