Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2A2P52657 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms