Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GATMP50440 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATMP50440 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367 ms