Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK1EP49674 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK1EP49674 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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