Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NESP48681 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NESP48681 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NESP48681 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms