Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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MMP13P45452 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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MMP13P45452 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MMP13P45452 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MMP13P45452 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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