Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms