Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms