Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIA1P42261 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms