Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
APOBEC1P41238 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms