Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBP2P32456 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBP2P32456 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms