Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD1P28340 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms