Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PLNP26678 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PLNP26678 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms