Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO2P25791 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO2P25791 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMO2P25791 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO2P25791 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO2P25791 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms