Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR1P24390 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms