Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPREP23469 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PTPREP23469 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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