Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA6P23229 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA6P23229 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms