Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIG1P18858 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms