Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF3P18847 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF3P18847 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF3P18847 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF3P18847 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF3P18847 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF3P18847 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF3P18847 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATF3P18847 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATF3P18847 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF3P18847 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms