Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB3P14651 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HOXB3P14651 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXB3P14651 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXB3P14651 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB3P14651 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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