Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNAP12004 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PCNAP12004 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNAP12004 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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