Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms