Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DQB1P01920 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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