Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAK2O60296 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms