Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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