Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E9PCH4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E9PCH4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E9PCH4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PCH4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms